Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSG101Q99816 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSG101Q99816 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms