Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPAS2Q99743 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms