Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP1Q99575 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP1Q99575 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POP1Q99575 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP1Q99575 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP1Q99575 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP1Q99575 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POP1Q99575 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP1Q99575 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP1Q99575 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP1Q99575 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP1Q99575 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP1Q99575 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP1Q99575 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP1Q99575 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP1Q99575 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP1Q99575 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP1Q99575 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP1Q99575 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP1Q99575 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POP1Q99575 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP1Q99575 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP1Q99575 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP1Q99575 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP1Q99575 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POP1Q99575 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP1Q99575 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP1Q99575 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP1Q99575 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP1Q99575 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP1Q99575 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP1Q99575 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP1Q99575 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POP1Q99575 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP1Q99575 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP1Q99575 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP1Q99575 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP1Q99575 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP1Q99575 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP1Q99575 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP1Q99575 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP1Q99575 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP1Q99575 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms