Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKP4Q99569 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP4Q99569 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms