Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD180Q99467 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD180Q99467 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD180Q99467 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD180Q99467 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CD180Q99467 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD180Q99467 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD180Q99467 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CD180Q99467 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD180Q99467 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD180Q99467 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD180Q99467 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD180Q99467 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD180Q99467 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD180Q99467 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD180Q99467 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD180Q99467 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD180Q99467 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD180Q99467 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD180Q99467 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD180Q99467 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD180Q99467 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD180Q99467 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD180Q99467 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD180Q99467 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD180Q99467 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD180Q99467 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms