Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC5LQ99459 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC5LQ99459 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC5LQ99459 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC5LQ99459 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC5LQ99459 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC5LQ99459 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDC5LQ99459 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC5LQ99459 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC5LQ99459 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC5LQ99459 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC5LQ99459 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC5LQ99459 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC5LQ99459 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC5LQ99459 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms