Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRAMP1Q96RY5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CRAMP1Q96RY5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 856.4 ms