Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF13CQ96RJ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF13CQ96RJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms