Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNAQ96QF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms