Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBP4Q96PP9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GBP4Q96PP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBP4Q96PP9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms