Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3BQ96NU0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3BQ96NU0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3BQ96NU0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3BQ96NU0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3BQ96NU0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3BQ96NU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3BQ96NU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP3BQ96NU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP3BQ96NU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms