Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOPNLQ96NB1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms