Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZFP42Q96MM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP42Q96MM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP42Q96MM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms