Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE2Q96MF7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms