Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALR3Q96L12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALR3Q96L12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms