Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LCORQ96JN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCORQ96JN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LCORQ96JN0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCORQ96JN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCORQ96JN0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCORQ96JN0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms