Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEC22AQ96IW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms