Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17Q96FV3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN17Q96FV3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN17Q96FV3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms