Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A6EQ96DS6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A6EQ96DS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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