Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RMDN1Q96DB5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RMDN1Q96DB5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms