Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ULK4Q96C45 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK4Q96C45 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.6 ms