Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF25Q96BH1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF25Q96BH1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF25Q96BH1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF25Q96BH1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF25Q96BH1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF25Q96BH1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF25Q96BH1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF25Q96BH1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms