Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VOPP1Q96AW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VOPP1Q96AW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VOPP1Q96AW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms