Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX4Q969G2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms