Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP13Q92995 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP13Q92995 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP13Q92995 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP13Q92995 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP13Q92995 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP13Q92995 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP13Q92995 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP13Q92995 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP13Q92995 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP13Q92995 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP13Q92995 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP13Q92995 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP13Q92995 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP13Q92995 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP13Q92995 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP13Q92995 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP13Q92995 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP13Q92995 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP13Q92995 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP13Q92995 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP13Q92995 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP13Q92995 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP13Q92995 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP13Q92995 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP13Q92995 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP13Q92995 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP13Q92995 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP13Q92995 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP13Q92995 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP13Q92995 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP13Q92995 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP13Q92995 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP13Q92995 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP13Q92995 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP13Q92995 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP13Q92995 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP13Q92995 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP13Q92995 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP13Q92995 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP13Q92995 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP13Q92995 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP13Q92995 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP13Q92995 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP13Q92995 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms