Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNPO1Q92973 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNPO1Q92973 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNPO1Q92973 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms