Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PRG4Q92954 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PRG4Q92954 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PRG4Q92954 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PRG4Q92954 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms