Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RORBQ92753 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RORBQ92753 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORBQ92753 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORBQ92753 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RORBQ92753 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RORBQ92753 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RORBQ92753 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RORBQ92753 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RORBQ92753 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RORBQ92753 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RORBQ92753 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RORBQ92753 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms