Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms