Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2Q8WWK9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.2 ms