Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKA2Q8WVK7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms