Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT1Q8TDG2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT1Q8TDG2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT1Q8TDG2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms