Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEST2Q8NFU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEST2Q8NFU1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEST2Q8NFU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms