Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C17orf47Q8NEP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf47Q8NEP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms