Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC197Q8NCU1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms