Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COLGALT1Q8NBJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COLGALT1Q8NBJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms