Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf163Q8N9P6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf163Q8N9P6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms