Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMTC2Q8N394 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMTC2Q8N394 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMTC2Q8N394 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMTC2Q8N394 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms