Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLGN4XQ8N0W4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLGN4XQ8N0W4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms