Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00518Q8N0U6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00518Q8N0U6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00518Q8N0U6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms