Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRSK2Q8IWQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRSK2Q8IWQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK2Q8IWQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms