Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSTM4Q8IW00 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms