Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC6Q8IVU3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERC6Q8IVU3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms