Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZD3Q86UT5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZD3Q86UT5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD3Q86UT5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms