Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF5Q86SE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF5Q86SE9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms