Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX6Q7RTT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms