Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYFIP1Q7L576 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 330.8 ms