Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SV2AQ7L0J3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2AQ7L0J3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2AQ7L0J3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms