Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP50Q70EL3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP50Q70EL3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP50Q70EL3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP50Q70EL3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP50Q70EL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP50Q70EL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP50Q70EL3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP50Q70EL3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP50Q70EL3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP50Q70EL3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms