Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM136Q6ZRR5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM136Q6ZRR5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms